NCBI؛ معرفی بخش‌های مختلف

مرکز ملی اطلاعات بیوتکنولوژی (NCBI) بخشی از کتابخانه‌ی ملی پزشکی ایالات متحده (NLM) است. وب‌سایت NCBI یک منبع آنلاین جامع است که دسترسی به طیف گسترده‌ای از اطلاعات زیست‌پزشکی و ژنومی، از جمله توالی‌های “DNA” و پروتئین، ادبیات علمی و پایگاه‌های داده‌های زیست‌پزشکی را فراهم می‌کند. NCBI بخش‌های مختلفی دارد که در ادامه به برخی از آن‌ها اشاره می‌کنیم.

Medline

مدلاین یک پایگاه داده‌ی کتاب‌شناسی و قسمتی از سایت NCBI است. مدلاین یکی از بزرگ‌ترین و جامع‌ترین پایگاه‌های داده‌ی ادبیات پزشکی در جهان است که شامل بیش از ۳۰ میلیون مرجع به مقالات مجله‌های علوم زیستی، از جمله پزشکی، پرستاری، دندان‌پزشکی، دامپزشکی و بهداشت عمومی می‌شود.

مدلاین از طریق وب سایت NCBI با استفاده از موتور جستجوی “PubMed” قابل‌جستجو است که به کاربران اجازه می‌دهد مقالات را بر‌اساس نویسنده، کلمات کلیدی یا عنوان‌های موضوعی پزشکی (اصطلاح MeSH) جستجو کنند. “MeSH” یک واژگان کنترل‌شده است که برای نمایه‌سازی مقالات در Medline استفاده می‌شود و به کاربران اجازه می‌دهد مقالات را بر اساس مفاهیم یا موضوعات خاص پزشکی جستجو کنند.

علاوه‌بر ارائه‌ی دسترسی به متن کامل بسیاری از مقالات، مدلاین همچنین لینک‌هایی به پایگاه داده‌های دیگر NCBI مانند “GenBank” (برای توالی‌های DNA)  و “PubChem” (برای ترکیبات شیمیایی) ارائه می‌دهد. مدلاین روزانه به‌روزرسانی می‌شود و هر روز مقالات جدیدی اضافه می‌شوند. این پایگاه داده شامل ارجاعاتی به مقالات منتشر‌شده در بیش از ۵۶۰۰ مجله از سراسر جهان است و طیف گسترده‌ای از موضوعات در علوم زیستی، از جمله تحقیقات پایه و بالینی، اپیدمیولوژی، فارماکولوژی، روانشناسی و غیره را پوشش می‌دهد.

مدلاین توسط کتابخانه ملی پزشکی (NLM)، که قسمتی از مؤسسه ملی بهداشت آمریکا است، تولید می‌شود. NLM مسئول نمایه‌بندی و چکیده‌سازی مقالات در مدلاین است و نگهداری و به‌روزرسانی پایگاه داده را انجام می‌دهد. مدلاین شامل مقالاتی از دهه ۱۹۴۰ است؛ اما اکثر مقالات مربوط به دهه ۱۹۹۰ به بعد هستند.

Medline به‌صورت رایگان در وب‌سایت NCBI در‌ دسترس است و همچنین از طریق پایگاه‌های داده و موتور‌های جستجوی دیگر مانند “Ovid” و “Web of Science” قابل‌دسترسی است؛ با این حال، برخی از مقالات ممکن است برای دسترسی به متن کامل نیاز به اشتراک یا پرداخت داشته باشند.

PubMed Central (PMC)

PMC یک آرشیو دیجیتالی رایگان از مقالات تمام‌متنی و بازبینی‌شده در علوم زیست‌پزشکی و زیستی است که توسط مرکز ملی اطلاعات بیوتکنولوژی (NCBI) که بخشی از مؤسسه ملی بهداشت (NIH) در ایالات متحده است، نگهداری می‌شود.

PMC  شامل مقالات هزاران مجله است؛ از جمله بسیاری از مجلاتی که در پایگاه داده Medline فهرست شده‌اند. با این حال، برخلاف Medline که فقط مرجع و خلاصه‌ی مقالات را فراهم می‌کند، PMC دسترسی به متن کامل مقالات را به صورت استاندارد ارائه می‌دهد که به‌راحتی قابل‌جستجو، خواندن و دانلود است. PMC همچنین دارای مقالاتی از رشته‌های مختلفی در علوم زیست‌پزشکی و علو‌م زندگی از جمله پزشکی، پرستاری، دندان‌پزشکی، پزشکی دامی، بهداشت عمومی، بیوتکنولوژی و… است.

علاوه‌بر ارائه‌ی دسترسی به مقالات با متن کامل، PMC ابزار‌ها و ویژگی‌های دیگری را نیز برای کمک به کاربران در کشف، خواندن و به اشتراک‌گذاری تحقیقات علمی ارائه می‌دهد. این شامل موارد زیر است:

۱. My NCBI

“My NCBI” یک ابزار شخصی‌سازی‌شده است که به کاربران این امکان را می‌دهد که جستجو‌ها را ذخیره و مدیریت کنند، برای مقالات جدید اعلانات ‌ایمیل تنظیم کنند و نتایج جستجوی خود را بر‌اساس علایق و ترجیحات خود سفارشی کنند.

۲. PMC Lab

“PMC Lab” یک پلتفرم برای کاوش و آزمایش ‌ایده‌ها و فناوری‌های جدید مربوط به انتشار علمی و به اشتراک‌گذاری داده‌ها است.

۳. PMC International

“PMC International” یک برنامه است که با شرکایی در سراسر جهان همکاری می‌کند تا تحقیقات علمی در جوامع محلی خود، بیشتر قابل‌دسترسی قرار گیرند.

PMC در سال ۲۰۰۰ با هدف ایجاد یک بایگانی دیجیتال رایگان در ادبیات علوم زیست‌پزشکی و علوم زندگی راه‌اندازی شد. از آن زمان به بزرگ‌ترین و پراستفاده‌ترین بایگانی دیجیتال ادبیات علمی در جهان تبدیل شده که شامل بیش از ۶ میلیون مقاله است و مقالات جدید به آن اضافه می‌شوند. مقالات از مجلات مختلفی شامل مجلات با دسترسی آزاد و مجلات با اشتراک استفاده می‌شوند. مقالات PMC در قالب‌های مختلفی از جمله “HTML”، “PDF” و “XML” در ‌دسترس هستند. مقالات به‌طور معمول با موارد تکمیلی مانند مجموعه‌ی داده‌ها، تصاویر و ویدئو‌ها همراه هستند که به اطلاعات بیشتر کمک می‌کنند.

GENE

GENE یک پایگاه داده از توالی‌های ژنی مشروح و اطلاعات مرتبط است که توسط NCBI در ایالات متحده نگهداری می‌شود که شامل اطلاعاتی در مورد بیش از ۴۰۰۰۰۰  ژن از گونه‌های مختلف شامل انسان، موش، موش صحرایی، مگس میوه و بسیاری دیگر است. برای هر ژن، GENE اطلاعات زیادی ارائه می‌دهد که شامل موارد زیر می‌شود:

۱. نام و نماد ژن؛

۲. محل کروموزومی؛

۳. محصولات پروتئینی و ایزوفرم‌ها؛

۴. حاشیه‌نویسی و توصیفات عملکردی؛

۵. واریانت‌های ژنتیکی و ارتباط با بیماری‌ها؛

۶. ساختار‌ها و تعاملات پروتئینی؛

۷. الگو‌های بیان و تنظیم؛

۸. روابط و تاریخچه تکاملی.

اطلاعات GENE به‌صورت رکورد‌های ژنی سازماندهی شده‌اند که می‌توان به آن‌ها از طریق وب‌سایت NCBI و یا ابزار‌های دیگری که از داده‌های GENE استفاده می‌کنند، جستجو کرد. این رکورد‌های ژنی به دیتابیس‌های دیگر NCBI مانند دیتابیس پروتئین، دیتابیس نوکلئوتید و دیتابیس PubChem متصل هستند که به کاربران این امکان را می‌دهد که داده‌های ژنی را به صورت گسترده تحلیل کنند.

علاوه‌بر ارائه‌ی دسترسی به توالی‌های ژنی و حاشیه‌نویسی، GENE  همچنین ابزار‌ها و منابع متنوعی را برای کمک به تحلیل و تفسیر داده‌های ژنی به محققان ارائه می‌دهد. این ابزار‌ها عبارتند از:

۱. BLAST

“BLAST” ابزار جستجوی تطبیق توالی محلی پایه است که به کاربران اجازه می‌دهد تا توالی‌ها را با یک پایگاه‌داده از توالی‌های شناخته‌شده، مقایسه کنند تا شباهت‌ها و روابط را شناسایی کنند.

۲. Entrez Gene

“Entrez Gene” یک موتور جستجو است که به کاربران اجازه می‌دهد تا بر‌اساس معیار‌های مختلفی مانند نام، نماد، توالی و حاشیه‌نویسی، ژن‌ها را جستجو کنند.

 ۳. Gene Expression Omnibus (GEO)

“GEO”، مخزن عمومی از داده‌های بیان ژنی از تجربیات و مطالعات گوناگون است.

۴. GeneReviews

“GeneReviews” یک منبع است که اطلاعات نوشته‌شده توسط کارشناسان تخصصی در مورد شرایط ژنتیکی و بیماری‌ها را ارائه می‌دهد.

به‌طور کلی، GENE یک منبع جامع و با کیفیت بالا از داده‌های ژنی، ابزارها و منابع مختلف را برای پشتیبانی از تحقیق و تحلیل داده‌ها ارائه می‌دهد. GENE یک پایگاه داده جامع از توالی‌های ژنی و حاشیه‌نویسی‌های آن‌ها است که داده‌های آن با توجه به در‌دسترس‌بودن توالی‌ها و حاشیه‌نویسی‌های جدید به‌روزرسانی می‌شود.

Online Mendelian Inheritance in Animals (OMIA)

OMIA یک پایگاه داده از ژن‌ها، اختلالات و ویژگی‌های به‌ارث‌رسیده در حیوانات است که توسط NCBI در ایالات متحده آمریکا نگهداری می‌شود. این پایگاه داده به عنوان بخشی از مجموعه‌ی بزرگی از پایگاه‌های داده و ابزار‌های ارائه‌شده توسط NCBI، در پشتیبانی از تحقیقات در علوم زندگی کاربرد دارد.

OMIA شامل اطلاعاتی در مورد اختلالات و ویژگی‌های به‌ارث‌رسیده در گونه‌های گوناگون حیوانی شامل پستانداران، پرندگان، ماهیان و خزندگان است. برای هر گونه حیوان، OMIA فهرستی از ژن‌های مرتبط با اختلالات و ویژگی‌های به‌ارث‌رسیده را به‌همراه شرح فنوتیپ، نحوه به‌ارث‌بردن و سایر اطلاعات مربوطه ارائه می‌دهد.

اطلاعات OMIA به‌صورت رکورد‌های جداگانه برای هر ژن، اختلال و ویژگی سازماندهی شده‌اند که می‌توان به آن‌ها از طریق وب‌سایت NCBI یا ابزار‌های دیگری که از داده‌های OMIA استفاده می‌کنند، دسترسی داشت و جستجو کرد. این پایگاه داده همچنین شامل لینک‌هایی به دیتابیس‌های دیگر NCBI مانند دیتابیس ژن و دیتابیس PubMed  است که به کاربران این امکان را می‌دهد تا داده‌های ژنتیک حیوانات را در زمینه‌های مختلف تحلیل کنند.

علاوه‌بر ارائه‌ی دسترسی به داده‌های ژنتیک حیوانات، OMIA همچنین ابزار‌ها و منابع متنوعی را برای کمک به تحلیل و تفسیر داده‌های ژنتیک در حیوانات ارائه می‌دهد. این ابزار‌ها به شرح زیر است:

۱. موتور جستجوی OMIA

موتور جستجوی OMIA به کاربران امکان می‌دهد ژن‌ها، اختلالات و صفات را بر‌اساس معیارهای مختلفی مانند گونه‌های حیوانی یا نحوه‌ی وراثت جستجو کنند.

۲. نقشه ژنی OMIA

نقشه ژنی OMIA، موقعیت ژن‌های مرتبط با اختلالات و ویژگی‌های به‌ارث‌رسیده در کروموزوم‌های گوناگون حیوانات را نشان می‌دهد.

۳. مرورگر OMIA

مرورگر OMIA، به کاربران اجازه می‌دهد تا دنباله‌های ژنی و حاشیه‌نویسی‌های مرتبط با اختلالات و ویژگی‌های به‌ارث‌رسیده در حیوانات را بررسی کنند.

در کل، OMIA یک منبع جامع و با کیفیت از داده‌های ژنتیک حیوانی و اطلاعات مرتبط را فراهم می‌کند و ابزار‌ها و منابع متنوعی را برای پشتیبانی از تحقیقات و تحلیل‌ها ارائه می‌دهد. OMIA به‌ویژه برای پزشکی دام، اصلاح نژاد حیوانی و زیست‌شناسی حفاظتی می‌تواند بسیار مفید باشد.

 (dbEST) Expressed Sequence Tags database

dbEST (پایگاه داده تگ توالی بیان‌شده) یک پایگاه داده از توالی‌های DNA حاصل از “cDNA” در گونه‌های مختلف است که توسط NCBI در ایالات متحده آمریکا نگهداری می‌شود. این پایگاه داده به‌عنوان بخشی از مجموعه‌ی بزرگی از پایگاه‌های داده و ابزار‌های ارائه‌شده توسط NCBI در پشتیبانی از تحقیقات در علوم زندگی کاربرد دارد.

dbEST  شامل میلیون‌ها توالی DNA به عنوان تگ توالی بیان‌شده (EST) است که از cDNA در بافت‌ها و مراحل توسعه‌ی مختلف گونه‌های متفاوت حاصل شده‌اند. اطلاعات dbEST برای هر “EST” به شکل رکورد، سازماندهی شده‌اند که از طریق وب‌سایت NCBI یا ابزار‌های دیگری که داده‌های dbEST را به‌کار‌می‌برند، قابل‌دسترسی و جستجو هستند. این پایگاه داده شامل لینک‌هایی به دیتابیس‌های دیگر NCBI مانند دیتابیس نوکلئوتید و دیتابیس ژن است که به کاربران این امکان را می‌دهد تا به داده‌های ژنی در زمینه‌های مختلف دسترسی پیدا کنند و آن‌ها را تحلیل کنند.

علاوه بر ارائه‌ی دسترسی به داده‌هایEST،dbEST  همچنین ابزار‌ها و منابع متنوعی را برای کمک به تحلیل و تفسیر داده‌های EST ارائه می‌دهد. این ابزار‌ها عبارتند از:

۱. موتور جستجوی dbEST

موتور جستجوی dbEST به کاربران اجازه می‌دهد تا EST‌ها را بر‌اساس معیار‌های مختلفی مانند گونه، نوع بافت یا نام ژن، جستجو کنند.

۲. مرورگر dbEST

مرورگر dbEST به کاربران اجازه می‌دهد تا داده‌های EST را در گونه‌های مختلف بررسی کنند و ترتیب توالی‌ها و اطلاعات حاشیه‌نویسی را مشاهده کنند.

۳. دیتابیس UniGene

دیتابیس “UniGene”، نمای جامعی از بیان و تنظیم ژن در بافت‌های مختلف و مراحل رشد در موجودات را ارائه می‌دهد.

به‌طور کلی، dbEST یک منبع ارزشمند برای پژوهشگرانی است که به بیان ژن و تنظیم آن در گونه‌های مختلف علاقه دارند. این پایگاه داده یک منبع کامل و با کیفیت از داده‌های EST است و ابزار‌ها و منابع متنوعی را برای پشتیبانی از تحقیقات فراهم می‌کند. dbEST می‌تواند به‌خصوص برای شناسایی ژن‌های نوآور، توصیف الگو‌های بیان ژنی و مطالعه‌ی پایه‌ی مولکولی بیماری‌ها و سایر فرایند‌های زیستی مفید باشد.

 (RefSeq) Reference Sequence

RefSeq (توالی مرجع) یک پایگاه داده جامع از توالی‌های مرجع برای ژنوم‌ها، ترانسکریپت‌ها و پروتئین‌ها است که توسط مرکز ملی اطلاعات بیوتکنولوژی (NCBI) در ایالات متحده آمریکا نگهداری می‌شود.

RefSeq  شامل مجموعه‌ای متنوع از توالی‌های مرجع برای گونه‌های مختلفی از جمله انسان، حیوانات، گیاهان و میکروارگانیسم‌ها است. برای هر گونه، RefSeq  یک توالی ژنوم مرجع و همچنین توالی‌های مرجع برای رونوشت‌ها و پروتئین‌هایی که از آن ژنوم مشتق شده‌اند، ارائه می‌کند.

اطلاعات RefSeq به‌صورت رکورد‌هایی برای هر ژنوم، ترانسکریپت یا پروتئین سازماندهی شده‌اند که از طریق وب‌سایت NCBI یا ابزار‌های دیگری که داده‌های RefSeq را به‌کار می‌برند، قابل‌دسترسی و جستجو هستند. این پایگاه داده شامل لینک‌هایی به دیتابیس‌های دیگر NCBI مانند دیتابیس ژن و دیتابیس PubChem است که به کاربران این امکان را می‌دهد تا به داده‌های ژنی در زمینه‌های مختلف دسترسی پیدا کنند و آن‌ها را تحلیل کنند.

علاوه‌بر ارائه‌ی دسترسی به توالی‌های مرجع،RefSeq  نیز منابع و ابزار‌های متنوعی را برای کمک به تحلیل و تفسیر داده‌های ژنومی و پروتئینی ارائه می‌دهد. این ابزار‌ها عبارتند از:

۱. موتور جستجوی RefSeq

موتور جستجوی RefSeq به کاربران اجازه می‌دهد تا توالی‌ها  را بر‌اساس معیار‌های مختلفی مانند گونه، نام ژن یا شباهت توالی، جستجو کنند.

۲. دیتابیس RefSeqGene

دیتابیس “RefSeqGene” یک مجموعه‌ی جامع و تنظیم‌شده از توالی‌های مرجع برای ژن‌ها در گونه‌های مختلف را فراهم می‌کند.

۳.  Genome Data Viewer

“Genome Data Viewer” به کاربران این امکان می‌دهد تا داده‌های ژنومی را در گونه‌های مختلف بررسی و تجسم کنند.

۴. بانک داده‌ی پروتئین

بانک داده‌ی پروتئین، دسترسی به ساختار‌های سه‌بعدی پروتئین‌ها و سایر ماکرومولکول‌ها را فراهم می‌کند.

به‌طور کلی، RefSeq یک منبع ارزشمند برای محققان علاقه‌مند به “Genomics”، “Transcriptomics” و “Proteomics” است. این یک منبع جامع و نظارت‌شده از توالی‌های مرجع و اطلاعات مرتبط را فراهم می‌کند و ابزار‌ها و منابع متنوعی را برای پشتیبانی از تحقیقات ارائه می‌دهد و برای شناسایی واریانت‌های ژنتیکی مرتبط با بیماری‌ها، توصیف الگو‌های بیان ژنی و مطالعه‌ی پایه‌های مولکولی فرایند‌های زیستی مفید باشد.

Genome Survey Sequence (GSS)

GSS یک پایگاه داده از توالی‌های DNA کوتاه تولید‌شده از قطعات تصادفی DNA ژنومی در طیف وسیعی از موجودات است که توسط مرکز ملی اطلاعات بیوتکنولوژی (NCBI) در ایالات متحده نگهداری می‌شود. GSS شامل میلیون‌ها توالی DNA با طول ۸۰۰ -۵۰۰ جفت‌باز است که از قطعات تصادفی DNA ژنومی تولید می‌شوند. این توالی‌ها می‌توانند اطلاعات ارزشمندی در مورد ساختار و سازماندهی ژنوم‌ها، از جمله توزیع عناصر تکراری، تراکم ژن‌ها و وجود عناصر قابل‌انتقال، ارائه دهند.

اطلاعات GSS به‌صورت رکورد‌هایی برای هر توالی سازماندهی شده‌اند که می‌توانند از طریق وب سایت NCBI یا ابزار‌های دیگری که شامل داده‌های GSS هستند، جستجو شوند. این پایگاه داده شامل پیوند‌هایی به دیگر پایگاه داده‌های NCBI مانند پایگاه داده نوکلئوتید و پایگاه داده ژنوم نیز است که به کاربران اجازه می‌دهد تا در محیط‌های مختلفی، داده‌های ژنومی را بررسی و تحلیل کنند.

علاوه‌بر ارائه‌ی دسترسی به داده‌های GSS، این پایگاه داده، منابع و ابزار‌های مختلفی را نیز برای کمک به تحلیل و تفسیر داده‌های ژنومی ارائه می‌دهد. این شامل موارد زیر است:

۱. موتور جستجوی GSS

موتور جستجوی GSS به کاربران اجازه می‌دهد تا توالی‌ها را براساس معیار‌های مختلفی مانند گونه، کروموزوم یا تشابه توالی، جستجو کنند.

۲. Genome Data Viewer

Genome Data Viewer به کاربران اجازه می‌دهد تا داده‌های ژنومی را در گونه‌های مختلف بررسی و بصری‌سازی کنند.

۳. ابزار BLAST

ابزار BLAST به کاربران اجازه می‌دهد تا توالی‌های GSS را با سایر توالی‌ها در پایگاه داده‌های مختلفی مانند پایگاه داده نوکلئوتید یا پایگاه داده پروتئین مقایسه کنند.

به‌طور کلی، GSS یک منبع ارزشمند برای پژوهشگران علاقمند به ساختار و سازمان ژنومی است. این پایگاه داده منبعی جامع و با کیفیت از داده‌های ژنومی و اطلاعات مرتبط را فراهم می‌کند و ابزار‌های و منابع مختلفی را برای پشتیبانی از تحقیق و تحلیل ارائه می‌دهد و برای شناسایی و توصیف عناصر تکراری، مطالعه تکامل ژنوم و بررسی پایه مولکولی بیماری‌های ژنتیکی، مفید است.

Bookshelf

Bookshelf مجموعه‌ای از کتاب‌های درسی زیست‌پزشکی و سایر متون آزاد است که توسط مرکز ملی اطلاعات بیوتکنولوژی (NCBI) در ایالات متحده نگهداری می‌شود. Bookshelf شامل طیف گسترده‌ای از ادبیات زیست‌پزشکی، از جمله کتاب‌های درسی، تک‌نگاری‌ها، مجموعه مقالات کنفرانس و موارد دیگر است. محتوا توسط تیمی از متخصصان مدیریت می‌شود و شامل آثاری از ناشران و منابع مختلف است. این کتابخانه به چندین مجموعه تقسیم‌شده است که شامل موارد زیر می‌شود:

۱. علوم زیستی و علوم زندگی

این مجموعه شامل کتاب‌های درسی و سایر متون است که موضوعاتی از قبیل ژنتیک، بیوشیمی، بیولوژی سلولی را پوشش می‌دهد.

۲. متون ارزیابی فناوری/ خدمات بهداشتی  (HSTAT)

این مجموعه شامل ادبیات مرتبط با تحقیقات خدمات بهداشتی و ارزیابی فناوری است مانند راهنمایی‌های بالینی و بررسی‌های سیستماتیک.

۳. کتابچه راهنمای NCBI

این مجموعه شامل مستندات و راهنمای کاربری برای پایگاه داده‌ها و ابزار‌های مختلف NCBI است.

۴. منابع آموزشی NCBI

این مجموعه شامل منابع آموزشی مانند آموزش‌ها، وبینار‌ها و ویدئو‌ها مرتبط با استفاده از پایگاه داده‌ها و ابزار‌های NCBI  است.

Bookshelf قابل‌جستجو است و می‌توان از طریق وب‌سایت NCBI یا ابزار‌های دیگری که شامل محتوای کتابخانه می‌شوند، به آن دسترسی پیدا کرد. Bookshelf حاوی لینک‌هایی به پایگاه داده‌ها و منابع دیگر NCBI  است؛ مانند PubMed و GenBank، که به کاربران این امکان را می‌دهد تا ادبیات زیست‌پزشکی را در زمینه‌های مختلف بررسی و تجزیه‌و‌تحلیل کنند.

در کل، Bookshelf یک منبع مفید برای پژوهشگران، دانشجویان و سایر افراد علاقه‌مند به ادبیات پزشکی است. این کتابخانه مجموعه‌ای جامع از کتاب‌ها و منابع دیگر است و ابزار‌های مختلفی را برای یادگیری و تحقیقات فراهم می‌کند.

Journals

قسمت Journals سایتNCBI  از طریق پایگاه دادهPubMed ، دسترسی به یک مجموعه‌ی گسترده از مجلات علوم زیستی و پزشکی فراهم می‌کند. PubMed یک موتور جستجوی رایگان است که دسترسی به بیش از ۳۲ میلیون مرجع از داده‌های Medline، مجلات علوم زیستی و کتاب‌های آنلاین را فراهم می‌کند. بخش Journals به کاربران این امکان را می‌دهد تا به آخرین تحقیقات در زمینه‌های مختلفی دسترسی پیدا کنند.

قسمت Journals  ابزار‌ها و ویژگی‌های مختلفی را برای کمک به کاربران برای بررسی و تحلیل ادبیات پزشکی ارائه می‌دهد، از جمله:

۱. قابلیت جستجو

کاربران می‌توانند با استفاده از کلمات کلیدی یا موضوعات MeSH (عنوان‌های موضوعی پزشکی) داده‌های پایگاه PubMed  را جستجو کنند تا به مقالات مرتبط با موضوعات خود دسترسی پیدا کنند.

۲. جستجوی پیشرفته

PubMed  یک رابط جستجوی پیشرفته را ارائه می‌دهد که به کاربران امکان می‌دهد نتایج جستجوی خود را بر‌اساس معیار‌های مختلفی مانند نام نویسنده، نام مجله، تاریخ انتشار و… تنظیم کنند.

۳. مجموعه مقالات

PubMed مجموعه‌های مقالات انتخاب‌شده در زمینه‌هایی مانند ۱۹COVID، ژنتیک و سرطان را ارائه می‌دهد.

۴. لینک به منابع مرتبط

PubMed  شامل لینک‌هایی به منابع مرتبط مانند پایگاه داده ژن و پایگاه داده پروتئین است که به کاربران امکان می‌دهد داده‌های پزشکی را در زمینه‌های مختلفی بررسی و تحلیل کنند.

۵. اطلاعات نقل‌قول

PubMed  برای هر مقاله اطلاعات نقل‌قول شامل عنوان، نویسنده، نام مجله، تاریخ انتشار و سایر فراداده‌ها را فراهم می‌کند؛ این باعث می‌شود که کاربران بتوانند به راحتی مقالات را در تحقیقات خود نقل‌قول کنند.

۶. مقالات تمام‌متن

بسیاری از مقالات موجود در PubMed دسترسی آزاد دارند؛ به این معنی که مقالات، تمام متن آن‌ها به‌صورت رایگان برای همه‌ی افراد با اتصال به اینترنت در‌دسترس هستند. برای مقالاتی که دسترسی آن‌ها آزاد نیست، PubMed  لینک‌هایی به وب سایت مجله یا منابع دیگری که مقاله تمام‌متن در آن‌ها قابل‌دسترسی است، فراهم می‌کند.

به‌طور کلی، بخش Journals سایت NCBI یک منبع ارزشمند برای پژوهشگران، دانشجویان و سایر افراد علاقه‌مند به ادبیات پزشکی است. این بخش دسترسی رایگان به مجموعه‌ای جامع از استنادها و مقالات تمام‌متن را فراهم می‌کند و ابزارها و منابع مختلفی را برای تجزیه و تحلیل داده‌های زیست‌پزشکی ارائه می‌دهد.

نویسنده: حدیث پرهیزکاری

ویراستار: سازا تاجدی

منابع:

1. https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/
2. https://www.ncbi.nlm.nih.gov/pmc/
3. https://omia.org/home/
4. https://www.ncbi.nlm.nih.gov/genbank/dbest/
5. https://www.ncbi.nlm.nih.gov/refseq/
6. https://www.ncbi.nlm.nih.gov/gss/