تکنیک های آزمایشگاهی

آشنایی با سیستم ژل داک

در این مقاله با سیستم ژل داک (Gel documentation) آزمایشگاهی آشنا شده و اطلاعاتی را در مورد نحوه کارکرد، موارد مورد استفاده، ویژگی‌های این سیستم و مزیت‌های آن در اختیارتان قرار می‌دهیم.

با Gel documentaton در زمان خود صرفه­‌جویی کنید

با پیشرفت علم­‌و­فناوری دستگاهی به­‌وجود آمده، که به اشتراک­‌گذاری داده­‌های شما با همکارانتان، کمک شایانی می­‌کند.

Gel Documentation

این سیستم، سیستمی است که عمدتاً در آزمایشگاه‌­های زیست­‌شناسی مولکولی، با هدف تصویربرداری نوکلئیک‌­اسیدها و پروتئین­‌ها مورد استفاده قرار می­‌گیرد و همچنین در ژل­‌های آگارز یا پلی­‌آکریل­‌آمید رنگ­‌آمیزی شده با فلوروفورها، مانند SYBR سبز یا اتیدیوم بروماید استفاده می­‌شود.

سیستم Gel Doc شامل منبع نور، نورافکن، دوربین مدار­بسته برای ثبت تصویر و اتاق تاریک یا کاپوت برای محافظت از بدن، در برابر اشعه­­‌ی ماوراء­ بنفش است. همچنین به­‌عنوان Gel imager و سیستم Gel image شناخته می­‌شود.

محیط استفاده از سیستم Gel documentation

از سیستم­‌های Gel Documentation در آزمایشگاه‌­های مهندسی­ ژنتیک در کالج­‌ها، موسسات تحقیقاتی مهندسی ژنتیک و صنایع دارویی تولیدکننده‌­ی پروتئین استفاده می­‌شود. همچنین کاربرد بسیاری در آزمایشگاه‌­های پزشکی ­قانونی و آزمایشگاه­‌های تحقیقات بالینی دارد.

هدف استفاده از سیستم Gel documentation چیست؟

Gel imaging  یا Gel documentation یک سیستم برای ثبت و اندازه­‌گیری پروتئین و اسیدنوکلئیک مشخص، در محیط­‌های گوناگون مانند آکریل‌­آمید، سلولز یا آگارز است. همچنین در ارزیابی سریع ژل­‌های پس از الکتروفورز، استفاده می­‌شود. بنابراین در مواد شیمیایی و زمان صرفه­‌جویی می­‌شود.

انواع مختلف سیستم Gel documentation

بسته به نوع نمونه و همچنین توان آن، تنظیمات و مشخصات متفاوتی در سیستم Gel Doc ارائه می‌­شود. سیستم­‌های مختلف شامل:

  • سیستم تصویربرداری شیمی‌­لومینسانس
  • سیستم­‌های تصویربرداری Gel دیجیتال
  • تجزیه­­‌وتحلیل لکه‌­ی خودکار
  • سیستم‌­های تصویربرداری فلورسانس چندگانه

سیستم تصویربرداری شیمی‌­لومینسانس

در آزمایشگاهی به نام علوم زندگی، وسترن­‌بلات یک تکنیک مهم برای جداسازی پروتئین­‌ها بر­اساس وزن مولکولی است. شیمی­‌لومینسانس به­‌عنوان یک روش تشخیص وسترن­‌بلات به­‌دلیل حساسیت بالا استفاده می­‌شود و سیستم­‌های تصویربرداری با این تکنیک، سرعت، حساسیت و ثبات سیگنال را بیشتر بهینه می‌­کنند.

Chemiluminescence imaging system

سیستم‌­های تصویربرداری Gel دیجیتال

از سیستم‌­های تصویربرداری Gel دیجیتال برای ضبط و اندازه‌­گیری ژل­‌های آکریل­‌آمید و آگارز رنگ‌­آمیزی­‌شده بر روی یک پلتفرم دیجیتالی استفاده می­‌شود. آنها نه تنها ذخیره‌­سازی موثر داده‌­ها را فراهم می­‌کنند بلکه کمّی دقیق نمونه­‌ها را نیز ارائه می­‌دهند.

انواع مختلفی از آشکارسازها (نور مرئی، اتیدیوم برومید (UV)، فلورسانس، شیمی لومینسانس، آشکارسازهای تراکم‌­سنجی) برای تجزیه‌­و­تحلیل کمّی نوارهای پروتئینی و نوکلئیک‌­اسید، میکروپلیت­‌ها و نقاط لکه‌­دار موجود است. این سیستم با استفاده از گزینه‌­های نوردهی خودکار و فوکوس خودکار، فرآیند دستیابی به تصویر را ساده می­‌کند.

digital gel imaging system

تجزیه­‌وتحلیل لکه­‌ی خودکار

سیستم‌های تجزیه‌­وتحلیل لکه‌­ی خودکار تصویرسازهای حساسی هستند که از نرم‌­افزارهای تخصصی در تجزیه‌­وتحلیل داده­‌های وسترن و اسید نوکلئیک استفاده می­‌کنند. این سیستم­‌ها قادر به اتوماسیون مانند تمرکز، انتخاب نور، قرارگرفتن در معرض و جذب هستند. محدوده­‌ی انتخابی از UV، مادون قرمز، رنگ RGB، فلورسانس، شیمی­‌لومینسانس است. همچنین دارای چندین کانال فلورسنت هستند که با سبب اندازه‌­گیری چندین هدف به­‌طور همزمان می‌­شود.

Automated blot analysis

سیستم‌­های تصویربرداری فلورسانس چندگانه

از سیستم‌­های تصویربرداری فلورسنت چندگانه، در روشنایی غشاهای لکه­‌گیر و تشخیص سیگنال­‌ها، از سرو­صدای پس ­زمینه استفاده می‌­شود. آنها همچنین در گرفتن تصویر لکه و تجزیه­‌و­تحلیل سیگنال­‌ها نقش دارند. اکثر سیستم‌­ها شامل منبع نور، فیلترهای انتشار و حسگر عکس (دوربین CCD یا CMOS)، منابع احتمالی نور RGB ،UV و نور سفید هستند.

  • برخی از سیستم­‌ها قادر به اجرای قابلیت­‌های چندگانه برای تشخیص و تصویر همزمان چندین سیگنال فلورسنت هستند.
  • برخی از سیستم­‌های تصویربرداری فلورسنت می­‌توانند سیگنال­‌های رادیو ایزوتوپی، درخشنده و رنگ­‌سنجی را تشخیص‌ ­دهند.
  • برخی از سیستم‌­ها از اصل اپتیکال کانونی برای افزایش حساسیت هنگام تشخیص اهداف در غلظت پایین استفاده می‌­کنند.

Multiplex fluorescence imaging systems

مزایای سیستم Gel documentation

  • اطلاعات بیشتری از مواد نمونه ارائه می‌­دهد و تکرارپذیری آزمایش­‌ها را بهبود می­‌بخشد
  • گردش کار راحت
  • به­‌عنوان یک رکورد در برابر دستکاری نتایج عمل می­‌کند.
  • ابزاری سازگار با CFR
  • تجزیه­‌وتحلیل دقیق­‌تر تصاویر
  • صرفه­‌جویی در زمان
  • عدم استفاده از مواد مصرفی پرهزینه
  • تقریباً هیچ ماده‌­ی شیمیایی مضری در آن دخیل نیست.
  • تجزیه­‌وتحلیل داده‌­های کمّی بیشتر از کیفی است
  • انعطاف­‌پذیری فلورسنت با قابلیت تکرارپذیری بهتر
  • به اشتراک­‌گذاری داده‌­ها با همکاران کمک می­‌کند.

نتیجه

یک سیستم Gel documentation پیش­نیاز هر آزمایشگاهی است که شامل تجزیه­‌ی پروتئین می­‌شود. بسته به سطح برنامه، پیکربندی و مشخصات متنوع با گزینه‌­ی سفارشی­‌سازی ارائه می‌­شود. از آنجا که بودجه برای هر آزمایشگاهی ضروری است، لازم است بهترین سیستم‌­ها متناسب با نیازهای هر آزمایشگاه خریداری شود.

نویسنده: زهرا سروآزاد

منابع:

  1. https://www.smacgigworld.com/blog/gel-documentation-systems.php
  2. https://www.cleaverscientific.com/electrophoresis/gel-documentation/

مقاله‌های مرتبط:

تعریف الکتروفورز به شیوه ساده و جامع

توضیح تکنیک PCR کلنی و نکات مربوط به آن

تکنیک الکتروفورز

دیدگاهتان را بنویسید

نشانی ایمیل شما منتشر نخواهد شد. بخش‌های موردنیاز علامت‌گذاری شده‌اند *

دکمه بازگشت به بالا