فهرست مطالب
در این مقاله با سیستم ژل داک (Gel documentation) آزمایشگاهی آشنا شده و اطلاعاتی را در مورد نحوه کارکرد، موارد مورد استفاده، ویژگیهای این سیستم و مزیتهای آن در اختیارتان قرار میدهیم.
با Gel documentaton در زمان خود صرفهجویی کنید
با پیشرفت علموفناوری دستگاهی بهوجود آمده، که به اشتراکگذاری دادههای شما با همکارانتان، کمک شایانی میکند.
این سیستم، سیستمی است که عمدتاً در آزمایشگاههای زیستشناسی مولکولی، با هدف تصویربرداری نوکلئیکاسیدها و پروتئینها مورد استفاده قرار میگیرد و همچنین در ژلهای آگارز یا پلیآکریلآمید رنگآمیزی شده با فلوروفورها، مانند SYBR سبز یا اتیدیوم بروماید استفاده میشود.
سیستم Gel Doc شامل منبع نور، نورافکن، دوربین مداربسته برای ثبت تصویر و اتاق تاریک یا کاپوت برای محافظت از بدن، در برابر اشعهی ماوراء بنفش است. همچنین بهعنوان Gel imager و سیستم Gel image شناخته میشود.
محیط استفاده از سیستم Gel documentation
از سیستمهای Gel Documentation در آزمایشگاههای مهندسی ژنتیک در کالجها، موسسات تحقیقاتی مهندسی ژنتیک و صنایع دارویی تولیدکنندهی پروتئین استفاده میشود. همچنین کاربرد بسیاری در آزمایشگاههای پزشکی قانونی و آزمایشگاههای تحقیقات بالینی دارد.
هدف استفاده از سیستم Gel documentation چیست؟
Gel imaging یا Gel documentation یک سیستم برای ثبت و اندازهگیری پروتئین و اسیدنوکلئیک مشخص، در محیطهای گوناگون مانند آکریلآمید، سلولز یا آگارز است. همچنین در ارزیابی سریع ژلهای پس از الکتروفورز، استفاده میشود. بنابراین در مواد شیمیایی و زمان صرفهجویی میشود.
انواع مختلف سیستم Gel documentation
بسته به نوع نمونه و همچنین توان آن، تنظیمات و مشخصات متفاوتی در سیستم Gel Doc ارائه میشود. سیستمهای مختلف شامل:
- سیستم تصویربرداری شیمیلومینسانس
- سیستمهای تصویربرداری Gel دیجیتال
- تجزیهوتحلیل لکهی خودکار
- سیستمهای تصویربرداری فلورسانس چندگانه
سیستم تصویربرداری شیمیلومینسانس
در آزمایشگاهی به نام علوم زندگی، وسترنبلات یک تکنیک مهم برای جداسازی پروتئینها براساس وزن مولکولی است. شیمیلومینسانس بهعنوان یک روش تشخیص وسترنبلات بهدلیل حساسیت بالا استفاده میشود و سیستمهای تصویربرداری با این تکنیک، سرعت، حساسیت و ثبات سیگنال را بیشتر بهینه میکنند.
سیستمهای تصویربرداری Gel دیجیتال
از سیستمهای تصویربرداری Gel دیجیتال برای ضبط و اندازهگیری ژلهای آکریلآمید و آگارز رنگآمیزیشده بر روی یک پلتفرم دیجیتالی استفاده میشود. آنها نه تنها ذخیرهسازی موثر دادهها را فراهم میکنند بلکه کمّی دقیق نمونهها را نیز ارائه میدهند.
انواع مختلفی از آشکارسازها (نور مرئی، اتیدیوم برومید (UV)، فلورسانس، شیمی لومینسانس، آشکارسازهای تراکمسنجی) برای تجزیهوتحلیل کمّی نوارهای پروتئینی و نوکلئیکاسید، میکروپلیتها و نقاط لکهدار موجود است. این سیستم با استفاده از گزینههای نوردهی خودکار و فوکوس خودکار، فرآیند دستیابی به تصویر را ساده میکند.
تجزیهوتحلیل لکهی خودکار
سیستمهای تجزیهوتحلیل لکهی خودکار تصویرسازهای حساسی هستند که از نرمافزارهای تخصصی در تجزیهوتحلیل دادههای وسترن و اسید نوکلئیک استفاده میکنند. این سیستمها قادر به اتوماسیون مانند تمرکز، انتخاب نور، قرارگرفتن در معرض و جذب هستند. محدودهی انتخابی از UV، مادون قرمز، رنگ RGB، فلورسانس، شیمیلومینسانس است. همچنین دارای چندین کانال فلورسنت هستند که با سبب اندازهگیری چندین هدف بهطور همزمان میشود.
سیستمهای تصویربرداری فلورسانس چندگانه
از سیستمهای تصویربرداری فلورسنت چندگانه، در روشنایی غشاهای لکهگیر و تشخیص سیگنالها، از سروصدای پس زمینه استفاده میشود. آنها همچنین در گرفتن تصویر لکه و تجزیهوتحلیل سیگنالها نقش دارند. اکثر سیستمها شامل منبع نور، فیلترهای انتشار و حسگر عکس (دوربین CCD یا CMOS)، منابع احتمالی نور RGB ،UV و نور سفید هستند.
- برخی از سیستمها قادر به اجرای قابلیتهای چندگانه برای تشخیص و تصویر همزمان چندین سیگنال فلورسنت هستند.
- برخی از سیستمهای تصویربرداری فلورسنت میتوانند سیگنالهای رادیو ایزوتوپی، درخشنده و رنگسنجی را تشخیص دهند.
- برخی از سیستمها از اصل اپتیکال کانونی برای افزایش حساسیت هنگام تشخیص اهداف در غلظت پایین استفاده میکنند.
مزایای سیستم Gel documentation
- اطلاعات بیشتری از مواد نمونه ارائه میدهد و تکرارپذیری آزمایشها را بهبود میبخشد
- گردش کار راحت
- بهعنوان یک رکورد در برابر دستکاری نتایج عمل میکند.
- ابزاری سازگار با CFR
- تجزیهوتحلیل دقیقتر تصاویر
- صرفهجویی در زمان
- عدم استفاده از مواد مصرفی پرهزینه
- تقریباً هیچ مادهی شیمیایی مضری در آن دخیل نیست.
- تجزیهوتحلیل دادههای کمّی بیشتر از کیفی است
- انعطافپذیری فلورسنت با قابلیت تکرارپذیری بهتر
- به اشتراکگذاری دادهها با همکاران کمک میکند.
نتیجه
یک سیستم Gel documentation پیشنیاز هر آزمایشگاهی است که شامل تجزیهی پروتئین میشود. بسته به سطح برنامه، پیکربندی و مشخصات متنوع با گزینهی سفارشیسازی ارائه میشود. از آنجا که بودجه برای هر آزمایشگاهی ضروری است، لازم است بهترین سیستمها متناسب با نیازهای هر آزمایشگاه خریداری شود.
نویسنده: زهرا سروآزاد
منابع:
- https://www.smacgigworld.com/blog/gel-documentation-systems.php
- https://www.cleaverscientific.com/electrophoresis/gel-documentation/
مقالههای مرتبط:
تعریف الکتروفورز به شیوه ساده و جامع
توضیح تکنیک PCR کلنی و نکات مربوط به آن