تکنیک های آزمایشگاهی

دستگاه BioMark HD

دستگاهی برای كپی از توالی­‌های DNA!

 

BioMark HD  یک سیستم PCR / qPCR خودکار و با کارایی بالا است که از فناوری میکروسیال برای پردازش نمونه‌ها در حجم‌های نانولیتری برای بیان ژن، ژنوتیپ، شناسایی نمونه، آنالیز تنوع تعداد کپی و PCR دیجیتال استفاده می‌کند.

سیستم Biomark HD شامل اجزای نوری، چرخه حرارتی و نرم­‌افزار است.

برای انجام بیان ژن به روشPCR ، داشتن ژنوتیپ و آنالیز دیجیتال نیز ضروری است.

سیستم Biomark HD برای PCR توان عملیاتی بالايی را ارائه می­‌دهد.

استفاده از سیستم BioMark HD یک روش سریع و قابل تکرار است.

زیرا چندین نمونه را می‌­توان در یک اجرا ارزیابی کرد.

گردش کار تقریباً خودکار است و به حداقل زمان عملی نیاز دارد.

با استفاده از سیستم‌  Fluidigm Biomark HD، یک راه‌اندازی سریع، انعطاف‌پذیر و توان بالا برای سنجش‌های بیان ژن چندگانه فراهم می­‌شود.

سنجش­‌ها می‌­توانند براساس پروب­‌ها یا رنگ اتصال به DNA باشند. 

براي انجام فرايند بیان ژن­‌های انتخاب شده، از 12 تا 192 ژن را می­‌توان انتخاب كرد.

این سیستم، به RNA بسیار کمی به­‌عنوان ورودی نیاز دارد و داده‌­های بسیار قابل تکرار ایجاد می­‌کند.

بيان ژن با استفاده از BioMark HD فقط به مقادیر کمی از DNA نیاز دارد، که آن را برای تجزیه‌­و­تحلیل نمونه‌های گران­‌بها بسيار كاربردی می‌کند.

نمایی از دستگاه BioMark HD

روش‌­های مورد استفاده‌ی دستگاه BioMark HD

واکنش زنجیره ای پلیمراز (PCR) كه روش كار دستگاه BioMark HD است؛ یک تکنیک آزمایشگاهی است که برای تکثیر توالی­‌های DNA استفاده می­‌شود.

این روش شامل استفاده از توالی­‌های DNA کوتاه به نام پرایمر برای انتخاب بخشی از ژنوم است که باید تکثیر شود.

دمای نمونه به‌­طور مکرر افزایش و کاهش می­‌یابد تا به آنزیم تکثیر DNA کمک شود.

توالی DNA هدف را کپی مي­‌کند.

این تکنیک می‌­تواند نسخه­­‌های زيادی از توالی هدف را تنها در چند ساعت تولید کند.

رونویسی ژن­‌ها یک فرآیند پویا است که به سلول­‌ها اجازه می­‌دهد تا به­‌سرعت با تغییرات خارجی، محیطی یا فیزیولوژیکی سازگار شوند.

mRNA اولین سطح کاوش برای هر تنظیمی در سطح مولکولی و سلولی است؛ و در زمینه‌های تحقیقاتی متعددی مانند انکولوژی، ایمونولوژی یا نورولوژی ضروری است.

این رویکرد می‌تواند هم ژن‌های خاص را هدف قرار دهد و هم می‌تواند به معنای کشف تفاوت‌های متعدد باشد.

به‌­عنوان مثال: بین گروه‌­های مختلف بیماران فرايند رونويسی ضروری است.

 PCRرونویسی معکوس کمی (RT-qPCR) زمانی استفاده می‌­شود که ماده اولیه RNA باشد.

در این روش ابتدا RNA توسط رونویسی معکوس از RNA کل یا RNA پیام­رسان (mRNA) به DNA مکمل (cDNA) رونویسی می­‌شود.

سپس از cDNA به­‌عنوان الگوی واکنش qPCR استفاده می­‌شود و سپس مانند روشPCR  بقیه مراحل انجام می­‌شود.

مراحل روش PCR

BioMark HD و كاربردهای آن در پزشکی

نازوفارنکس انسان یک بستر مناسب برای چندین پاتوژن تنفسی از جمله استرپتوکوک پنومونیه، استافیلوکوکوس اورئوس، موراکسلا کاتارالیس و هموفیلوس آنفولانزا است.

فارنکس، اصطلاح پزشکی است که برای حلق به کار می­‌رود.

حلق شامل سه بخش است؛ نازوفارنکس، قسمت پشت بینی را به پشت دهان متصل می­‌کند.

نازوفارنکس، بالای ناحیه نرمی در قسمت پشت سقف دهان قرار گرفته و امکان مشاهده مستقیم این ناحیه وجود ندارد.

اما با نگاه­‌کردن در آینه می­‌توانید نازوفارنکس را مشاهده کنید.

تعداد کمی از داده‌­ها و یافته­‌های متناقض در مورد فعل و انفعالات بین این باکتری­‌ها در نازوفارنکس انسان وجود دارد.

علاوه براین، اکثر مطالعات از روش‌های مبتنی بر کشت غیرکمی استفاده کرده‌اند، با کمبود داده‌های موجود برای کمک به درک عملکرد این باکتری‌ها در نازوفارنکس روش­‌های مبتنی بر PCR توسعه یافته‌­اند، که به درک ما درباره بیماری کمک می­‌کند.

نتيجه‌­گيری

دستگاه BioMark HD يك دستگاه كاربردی است كه به ما امكان می­‌دهد تا بتوانيم تعداد زيادی كپی از توالی مورد نظر خودمان چه در DNA و چه درRNA داشته باشيم.

علاوه­‌براین، می­‌توانیم بیماری­‌های مشخصی از بیماری­‌های حلق را به کمک روش PCR تشخیص داده و به بهبود آن کمک کنیم.

 

گردآورنده: صبامعجزاتی

 

منابع

fluidigm

genome

nature

fluidigm

 

دیدگاهتان را بنویسید

نشانی ایمیل شما منتشر نخواهد شد. بخش‌های موردنیاز علامت‌گذاری شده‌اند *

دکمه بازگشت به بالا