SARS-CoV-2

توسعه پروتکل های SARS-CoV-2 برای آزمایشگاه های تحقیقاتی

۸۰ درصدکل پروتئین های SARS-CoV-2 تولید شده در آزمایشگاه ، پروتکل های موجود برای تحقیقات

در سراسر جهان – دانشگاه گوته فرانکفورت ، آلمان ، مرکز تحقیقاتی ۱۷ کشور را تشکیل می دهد.

وقتی ویروس SARS-CoV-2 جهش می یابد ، این در ابتدا فقط به معنای تغییر در نقشه ژنتیکی آن است.

جهش ممکن است منجرشود تا ، به عنوان مثال ، یک اسید آمینه در یک مکان خاص در یک پروتئین ویروسی

رد و  بدل شود. به منظور ارزیابی سریع تأثیر این تغییر ، یک تصویر سه بعدی از پروتئین ویروسی بسیار مفید

است؛ این بدان دلیل است که نشان می دهد آیا تغییر در اسید آمینه عواقبی برای عملکرد پروتئین یا برای

تعامل با یک دارو  یا آنتی بادی بالقوه اثر دارد.

محققان دانشگاه گوته فرانکفورت و TU Darmstadt از همان ابتدای شیوع همه گیری شبکه های بین المللی

را آغاز کردند.

هدف تشکیل این شبکه :

هدف این شبکه توصیف ساختارهای سه بعدی مولکولهای SARS-CoV-2 با استفاده از طیف سنجی تشدید

مغناطیسی هسته ای (NMR) بود. در طیف سنجی NMR ، مولکول ها ابتدا با انواع خاصی از اتم ها (ایزوتوپ ها)

برچسب گذاری می شوند و سپس در معرض یک میدان مغناطیسی قوی قرار می گیرند. سپس می توان از

NMR برای بررسی دقیق و با توان زیاد نحوه اتصال ترکیبات بالقوه فعال به پروتئین های ویروسی استفاده کرد.

این کار در مرکز تشدید مغناطیسی بیومولکولی (BMRZ) در دانشگاه گوته و سایر مکان ها انجام می شود. با این

حال ، پیش نیاز اصلی تولید مقادیر زیادی پروتئین با خلوص و پایداری بالا و با تا شدن صحیح آنها نیازمند تعداد

زیادی آزمایش است.

این شبکه با هماهنگی پروفسور هارالد شوالب از انستیتوی شیمی آلی و بیولوژی شیمی در دانشگاه گوته ،

کره زمین را پوشش می دهد. تدوین پروتکل های آزمایشگاهی برای تولید پروتئین ها در حال حاضر مرحله دوم است.

علاوه بر پروتئین ها ، ویروس از RNA نیز تشکیل شده است و کنسرسیوم سال گذشته کلیه قطعات مهم RNA

SARS-CoV-2 را در دسترس قرار داده است. با تخصص ۱۲۹ همكار ، هم اكنون امكان توليد و تصفيه ۲۳ از مجموع

تقريباً ۳۰ پروتئين SARS-CoV-2 به طور كامل يا به عنوان قطعات مربوطه “در لوله آزمايش” و به مقدار زياد فراهم

شده است. برای این منظور ، اطلاعات ژنتیکی این پروتئین ها در قطعات کوچک حلقه ای شکل DNA (پلاسمیدها)

قرار گرفت. سپس این پلاسمیدها برای تولید پروتئین به باکتری ها وارد شدند. برخی از پروتئین های خاص نیز

در سیستم های فاقد سلول تولید شدند. اینکه آیا این پروتئین ها پس از جداسازی و غنی سازی آنها هنوز به

درستی جمع شده اند ، از جمله با طیف سنجی NMR تأیید شده است.

SARS-CoV-2

تلاش محققان در رابطه با پروتئین های SARS-CoV-2:

دکتر مارتین هنگسباخ از انستیتوی شیمی آلی و بیولوژی شیمی در دانشگاه گوته توضیح می دهد: “ما واحدهای

عملکردی پروتئین های SARS-CoV-2 را جدا کرده ایم به گونه ای که ساختار ، عملکرد و فعل و انفعالات آنها توسط

خود ما قابل توصیف است. با این کار ، کنسرسیوم بزرگ ما پروتكل های كاری را ارائه می دهد كه به آزمایشگاه

های سراسر دنیا اجازه می دهد تا به سرعت و به طور قابل تولید روی پروتئین های SARS-CoV-2 و همچنین جهش

های آینده كار كنند. توزیع این کار از ابتدا یکی از مهمترین اولویت های ما بود. علاوه بر پروتکل ها ، ما همچنین پلاسمید

ها را به صورت رایگان در دسترس قرار می دهیم. “

دکتر آندریاس شلوند از انستیتوی علوم زیستی مولکولی در دانشگاه گوته می گوید: “با کار ما ، سرعت جستجوی

جهانی برای عوامل فعال را تسریع می کنیم: آزمایشگاه های علمی مجهز به این کار لازم نیست ابتدا چندین ماه

را برای ایجاد و بهینه سازی سیستم ها صرف تولید و بررسی پروتئین های SARS-CoV-2 کنند، اما اکنون به لطف

پروتکل های مفصلی ما می توانند کار تحقیقاتی خود را طی دو هفته آغاز کنند.

با توجه به جهش های متعدد SARS-CoV-2 در آینده ، دسترسی به روش های قابل اعتماد ، سریع و ثابت برای

مطالعه ویروس در آزمایشگاه از اهمیت ویژه ای برخوردار است. به عنوان مثال ، این امر همچنین تحقیق در مورد

پروتئین های به اصطلاح کمکی SARS-CoV-2 را که هنوز تحت بررسی قرار نگرفته اند ، اما در بروز جهش ها نیز

نقش دارند ، تسهیل کند. “در همین حال ، کار در کنسرسیوم NMR ادامه دارد: در حال حاضر ، محققان به سختی

کار می کنند تا بفهمند پروتئین های ویروسی می توانند به داروهای بالقوه متصل شوند یا خیر.

بودجه کار تحقیقاتی توسط بنیاد تحقیقات آلمان و صندوق گوته کرونا ویروس تأمین شد. تلاش لجستیکی بالا و برقراری

ارتباط مداوم نتایج تحقیق توسط Signals ، یک شرکت فعال دانشگاه گوته پشتیبانی شد.

 

ترجمه: سیما تقی زاد

منبع: scitechdialy

منابع تصاویر : jacionline / kore.co.uk

0 پاسخ

دیدگاه خود را ثبت کنید

تمایل دارید در گفتگوها شرکت کنید؟
در گفتگو ها شرکت کنید.

دیدگاهتان را بنویسید

نشانی ایمیل شما منتشر نخواهد شد. بخش‌های موردنیاز علامت‌گذاری شده‌اند *